Richard Koche

Die Unterstützung der Stiftung Charité für diese BIH-Gastprofessur diente der Stimulierung neuer Forschungsarbeiten in der pädiatrischen Onkologie sowie der Festigung einer langfristigen Beziehung zwischen Forschenden des Memorial Sloan Kettering Cancer Center und der Charité – Universitätsmedizin Berlin. Es sind gerade die sich überschneidenden Forschungsinteressen und die sich ergänzenden Fähigkeiten von wet-lab Wissenschaftler/innen, Mediziner/innen und den theoretisch tätigen Bioinformatikern, die Synergieeffekte ermöglichen, die in einer Zeit erforderlich sind, in der Daten immer leichter zu generieren sind, aber echte Lösungen für dringende Probleme in der Krebsbiologie nicht leicht zu finden sind. Die Zusammenarbeit in diesem Projekt hat nicht nur dazu beigetragen, Wissenschaftler/innen aus dem Labor und aus der Medizin in der Dateninterpretation und -analyse zu schulen, sondern hat auch neue Wege für die Entwicklung und mögliche Behandlung von Kinderkrebs eröffnet.
Extrachromosomale zirkuläre DNA (ecDNA) ist ein bisher unterschätzter onkogener Faktor, der bei bis zu 30 % aller Krebsarten auftritt und wahrscheinlich für die Heterogenität und Therapieresistenz von verschiedenen Tumoren verantwortlich ist. Unsere Studien konzentrierten sich auf das Neuroblastom, den häufigsten extrakraniellen soliden Tumor im Kindesalter, bei dem etwa 25 % der Patienten ecDNA-gesteuerte Tumoren haben. Unter der Leitung von Prof. Dr. Angelika Eggert und im Labor von Prof. Dr. Anton Henssen versuchten wir, die Rolle der zirkulären DNA bei der Tumorentstehung des Neuroblastoms besser zu verstehen. Wir setzten eine Vielzahl von rechnerischen und experimentellen Ansätzen ein, um uns auf drei Schlüsselbereiche zu konzentrieren: i) verbesserte Erkennung und Klassifizierung zirkulärer DNA, ii) die funktionellen Auswirkungen zirkulärer DNA sowohl auf das Zirkulom als auch auf lineare Chromosomen und iii) Auswirkungen auf den klinischen Verlauf von Neuroblastompatienten. Die Entdeckungen, die im Laufe dieser Gastprofessur in allen drei Bereichen gemacht wurden, haben zu Veröffentlichungen in hochrangigen Fachzeitschriften sowie zu Auszeichnungen geführt, die unsere innovativen Ansätze für schwierige Probleme in der Krebsbiologie würdigen. Diese gemeinsamen Studien zur ecDNA bieten einen fruchtbaren Boden, von dem aus zahlreiche künftige Studien gestartet werden können. Wichtig ist auch, dass sie einen Einblick in die Tumorevolution und die Therapieresistenz geben, was möglicherweise neue Wege zur Erforschung neuer Therapeutika für einen pädiatrischen Tumor eröffnet, für den es viel zu oft keine nachhaltigen Behandlungsmöglichkeiten gibt.